1、所属层次不同，统招本科的学生是通过高考，考取全日制本科院校，属于国家普通高等教育体系。自考本科是由各省负责考试安排，通过后学习形式有函授和业余两种，非全日制，属于成人继续教育体系。

2、考试难度不同：统招需要通过高考，考试难度大，考试科目少且不涉及本科专业知识。自考相对于统招来说，考试简单，考试机会多，对考试次数限制少，但是自考本科的专业课在考试科目中占大比重，因而复习课本多且散。

3、含金量不同：统招本科毕业的学生的本科学历是第一学历，在学位证上有统招(全日制)的字样。而自考本科的第一学历是自考本科前的学历，本科学历是第二学历，且在毕业证上会有“成人教育”的字样。总体上来说，自考的含金量没有统招含金量高。但是远高于其他成人继续教育含金量。

4、灵活性不同：统招的必须全日制的上，自考的不需要，可根据自己的业余时间来调配。

5、毕业证上记载的区别：自考的毕业证上面有两个章，一个主考院校的，一个当地自考委的，内容为某某参加某某专业学历某某层次考试，成绩合格，准予毕业。统招的毕业证只有毕业院校的章。